Problema Central: Baja calidad y cobertura en servicios de agua potable y saneamiento en el municipio.
Situación: Las veredas de La Mesa, Carrizal y Platanal tienen un acueducto veredal, denominado ACUASPLAMECA el cual no recauda ingresos, pero suple las necesidades de los habitantes. El acueducto beneficia a Platanal: 87 Familias, La Mesa: 22 Familias, Carrizal: 26 Familias. En la zona urbana la cobertura asciende al 99%, mientras que para la zona rural la cobertura corresponde a un 38,68% tomando como referencia que de las 19 veredas que tiene el municipio hay 7 que poseen acueducto. El acueducto urbano se abastece de un afloramiento situado en la parte baja de la vereda San Ignacio, Municipio de San Miguel en la Finca Balahula. El sistema de acueducto cuenta con un sistema de captación compuesto por dos bocatomas que funcionan en forma alterna, las cuales están conectadas a un desarenador y de allí por una tubería de conducción a los tanques de almacenamiento que funcionan como reguladores para ser emisarios a la red de distribución. La red de conducción tiene una longitud aproximada de 6 kilómetros. Por otra parte, en la cabecera municipal existe una red de alcantarillado que da cubrimiento a las viviendas existentes y se cobra a la Resolución de la Superintendencia de Servicios Públicos. El vertimiento de las aguas negras se realiza sin ningún tratamiento; estas son directamente vertidas al río Chicamocha en seis puntos diferentes a lo largo de su recorrido; la Palmera, Hospital, Plaza de Mercado, calle de la alcaldía, barrio San Antonio, entrada al barrio Santo Domingo, con un caudal promedio de 27.3 Lt/seg. La tubería es de gres vitrificado de diámetro 8´, Fue construido hace 30 años. En la actualidad se cobra por este servicio. El municipio de Capitanejo tiene una cobertura total de 59,47% de servicio de alcantarillado, en el sector urbano la cobertura es de 94,78% y en los centros poblados y rural disperso es de 1,29%. La variación de prestación del servicio del 2005 al 2018 es del 7.56%.
Magnitud: El servicio de acueducto en el municipio, cuenta con una cobertura del 76.35%, el alcantarillado alcanza una cobertura de 59.47%, y el servicio de recolección de basuras es de 61.04%.